Традиционная оценка племенной ценности быка по качеству потомства занимает пять-шесть лет: нужно дождаться, пока дочери отелятся и завершат первую лактацию. Геномный подход сокращает этот срок в разы.
Принцип
У животного определяют состояние десятков тысяч однонуклеотидных полиморфизмов по всему геному. Затем с помощью референтной популяции — животных с известной продуктивностью и известным генотипом — рассчитывают вклад каждого участка генома в интересующие признаки.
Полученная модель позволяет оценивать племенную ценность любого животного сразу после рождения, по образцу ткани или крови.
Что это даёт
- Сокращение интервала между поколениями — главный источник ускорения генетического прогресса.
- Возможность оценивать признаки, проявляющиеся у одного пола: молочную продуктивность у быков.
- Оценка признаков с низкой наследуемостью, плохо поддающихся традиционным методам: устойчивость к заболеваниям, воспроизводительные качества.
- Ранняя выбраковка неперспективного молодняка, экономия на его выращивании.
Ограничения
Точность прогноза зависит от размера и качества референтной популяции. Для распространённых пород с крупными базами данных оценка надёжна; для малочисленных пород и локальных популяций точность ниже.
Модель, построенная на одной популяции, хуже работает на другой из-за различий в структуре сцепления генов. Поэтому национальные и породные референтные базы имеют самостоятельную ценность.
Риск ускорения
Быстрый прогресс сопровождается быстрым сужением генетического разнообразия: интенсивно используются немногие лучшие производители. Контроль инбридинга при геномной селекции становится более важным, чем при традиционной.